目前，烟气脱硫已成为控制火电厂二氧化硫排放的主要手段，初步分析，我国已具备了约4000万千瓦/年规模脱硫装置的产业化能力。
　工程巨大，问题多多
　火电厂二氧化硫控制涉及到法规、政策、经济、技术、产业化、管理等诸多方面，是一项巨大的系统工程，我国火电厂二氧化硫控制中存在的问题是多方面的也是多层次的。
　首先，企业对依法治企的认识不足。一些企业对超标即违法认识不到位，错误认为排污缴费合算，宁愿意缴费也不愿意治理。我国环保法规规定不论是否缴费，超标就是违法，超标就要治理，缴费不免除污染治理责任。
　其次，新建电厂脱硫进展顺利，但现有电厂的脱硫举步维艰。我国新建电厂排放标准与发达国家已经处于同一水平线上，再加上总量控制等要求，从项目审批结果看，几乎全部燃煤电厂都要建脱硫装置，包括了含硫量低于0.5电厂甚至是低于0.2的电厂建脱硫装置，而且几乎清一色都是高脱硫效率的石灰石-石膏湿法，可以说是严之又严。但同时，现有超标电厂、高硫煤的电厂脱硫进展缓慢，与排放标准和两控区“十五”规划要求相比，还有很大差距。
　　再者，法规文件很多，但企业却难以分清哪些是依法要求。1998年以来，仅国家层面上，已有三十多个与控制火电厂二氧化硫排放相关的法规、政策、规划和文件，直接关系脱硫的就有十多个文件，虽然有的文件是配套关系，但存在相互间矛盾、不协调现象，如果加上地方的要求和报告书的批复文件的要求，不要说企业就是一些环保行政主管人员也很难说清哪些是法定的要求，排放是否合法成了一本糊涂帐。
　　三条主线，完善法规
　　首先，加强对控制二氧化硫排放的法规、标准及以总量分配等要求的清理、整合。针对控制二氧化硫排放的不同目的和总体目标，建议围绕三条主线进行。第一条主线，排放标准。排放标准限值的确定应主要以地区间发展不平衡和烟气脱硫的技术、经济可行性为原则；第二条主线，总量控制。主要是三个目的，一是为解决在一个区域中单个点源达标、但区域环境容量不够的问题，二是为调整不合理的地区产业结构，三是解决国内跨区域的酸雨问题。第三条主线，建设项目的环境影响评价。主要是在前两条主线的前提下解决具体工程的特殊环境要求。前两条是基础，尤其第一条是重点。因此，应当以排放标准和总量分配为两条主线要求进行梳理、整合，避免交叉、矛盾、混乱，达到系统、明确、协调和可操作。
　　依法监督，科学监督
　　一是超标的要依法监督，二是已建的脱硫设施要严格监督、科学监督。如果做不好监督，脱硫设施运行不好，不仅造成巨大的投资浪费，增加的电费得不到环境回报，而且电力企业和一些投机脱硫设备建造企业从中不法牟利。监督加强也会反馈促进法规、标准的适用性和科学性，从根本上促进环保和经济的协调发展。
　　脱硫装置的运行要靠仪器的检测，因此，加强科学监督更为重要。一是要充分用好连续监测系统进行监督；二是要研究建立一种企业自查、自报、行业自律、政府抽查监督、公众及媒体参与的机制。大力鼓励、表扬守法者，依法处罚违法者。
　　落实政策，推进交易
　　切实解决现有电厂二氧化硫控制成本问题、尤其是电价不能到位的关键问题，这不仅是解决烟气脱硫设施能否建设的问题，也是解决脱硫装置能否真正发挥作用的根本所在。
　　再者要大力推进二氧化硫在电力行业内的排放交易制度。中国电力行业具有二氧化硫排放总量大、电源分布广、地区间发展不平衡、环境质量不平衡、不同企业和不同含硫量治理成本高低相差悬殊、电力投资主体多元化等特点，因此，实行二氧化硫排污交易可以达到事半功倍的效果。推广应用排污交易，要解决四方面的问题：一是最高决策层要下决心；二是，要出台相关规定；三是要设计好在中国国情条件下的具体实施的框架和操作方法。四是电力企业（实施的主体）应能真实地体会到排污交易带来的量化的收益。
　　除此之外，还要加强脱硫技术规定、规范的制定，这是保证烟气脱硫设施安全、高效、稳定运行的必要条件；同时强化行业自律，主要是通过脱硫供应方组成的环保产业协会自律和脱硫用户侧行业协会的自律。一方面，保证脱硫产业的健康发展，提供质优价廉的产品和服务，另一方面，要保证脱硫设备的安全、可靠、长期运行。